在微信经营商户时遇到功能受限异常，并影响到结算流程，可以采取以下措施来应对：
首先，需要登录微信商户平台或微信支付商家助手，查看具体的原因和解决方案。可能的原因包括但不限于：
经营模式问题：商户的经营模式可能涉及违反国家法律法规的业务，如黄赌毒等。
虚假交易或违规行为：商户可能进行虚假交易或存在其他违规行为，如没有实名认证、涉嫌虚假宣传等。
顾客投诉：顾客对商户的产品或服务不满意，进行了多次举报和投诉，而商户未能及时处理。
跨类目经营：商户使用与核准经营范围不符的收款码进行交易，或在微信平台上经营不符合其所属类目的商品或服务。
根据受限原因，采取相应的措施进行整改：
调整经营模式：立即停止违规经营行为，并调整经营模式以符合法律法规和微信支付平台的要求。
处理虚假交易和违规行为：如存在虚假交易或违规行为，应立即纠正，并加强内部管理，防止类似问题再次发生。
处理顾客投诉：建立有效的顾客投诉处理机制，及时回应并处理顾客投诉。同时，提升产品或服务质量，以减少顾客投诉的发生。
调整经营范围：确保所经营的商品或服务符合微信支付平台的要求，避免跨类目经营。
整改完毕后，可以登录微信商户平台或微信支付商家助手提交申诉。申诉前，需要准备以下材料：
违规记录详情：详细查阅并了解微信支付后台中关于违规的记录详情，包括违规原因、时间等信息。
相关证明材料：根据违规原因，收集并准备相关证明材料，如交易凭证、身份证明等。
申诉说明：撰写一份详尽的申诉说明，阐述对违规情况的认知、改进措施以及对违规原因的澄清。
提交申诉后，需要耐心等待微信支付平台的审核结果。审核期间，可以保持与微信支付平台的沟通，了解审核进度和可能需要补充的材料。
为了避免类似问题再次发生，商户应加强后续管理：
遵守规定：严格遵守微信支付平台的规定和国家法律法规，确保经营活动的合规性。
加强内部管理：完善内部管理制度，加强对员工的培训和教育，提高合规意识。
定期自查：定期对经营活动进行自查，及时发现并纠正潜在问题。
综上所述，当微信经营商户遇到功能受限异常并影响到结算流程时，应通过了解受限原因、采取整改措施、提交申诉材料、等待审核结果以及加强后续管理等步骤来应对。同时，商户应保持冷静和耐心，遵循微信支付平台的流程和规定进行操作。
